當我們在使用滅菌器時，需要注意一些事項，這些事項都有，安裝或放空熱水器內的水后應注意，必須先將熱水器注滿水后，才能接通電源開機使用；每次使用前須檢查滅菌劑是否有藥劑；滅菌過程進行中不得開箱蓋。關蓋失敗時，再次按開蓋鍵，重新關蓋；滅菌劑在使用前檢查是否異常，無異常情況可以使用；不防水的器械不能采用本設備進行滅菌；所有內鏡管腔必須清洗干凈，可拆卸的零件均須拆開后滅菌，帶開關的器械打至“打開”位置;滅菌盤內器械排放自然，整齊，連接膠管和器械軟管不得有折疊、扭曲等現象;滅菌時軟管按盤內圓弧形放置，不得隨意扭曲。
       使用醫用滅菌器對器械滅菌時，滅菌時器械擺放不得超過有效容積的百分之八十；滅菌完畢后若打印出“滅菌失敗”的標識應通知廠家檢查處理；滅菌后的器械物品，須存放于無菌環境中，盡量縮短器械從滅菌到使用的間隔時間，避免器械二次污染；發現箱蓋有滲水現象，立即通知有關人員更換機蓋上的密封條；每天開機前、關機后作簡單的清潔工作，用干布將滅菌艙擦干凈，然后用70%酒精擦拭機蓋內外表面，并蓋好蓋。長時間不用時，每隔7天自動運行一次。每月做一次全面清潔，更換過濾器濾芯。放熱水器的水，重新罐滿，并在使用前用滅菌劑運行一次后，方可進行器械滅菌。